RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GKN3PP0CG01 181 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC130P13994 396 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 IMPDH1P20839 514 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OMGP23515 440 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCGB2A2Q13296 93 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FZD2Q14332 565 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OXA1LQ15070 435 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM92BQ6ZTR7 304 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAIP1Q8WWC4 291 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM3CQ92520 227 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 AMDHD1Q96NU7 426 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2A5Q96R48 311 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPS2Q9BXY5 557 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB34Q9BZG1 259 aa1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FANCIQ9NVI1 1328 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK13O15264 365 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPSAP2O60256 369 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFN2O95140 757 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 AP2A1O95782 977 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHG4P01861 327 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPS2P11908 318 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MMP11P24347 488 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 DDOSTP39656 456 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP3K8P41279 467 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAP1AP62834 184 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFRSF17Q02223 184 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACVR1Q04771 509 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 INAQ16352 499 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 BEND3Q5T5X7 828 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1orf94Q6P1W5 598 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CES3Q6UWW8 571 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 H2AFVQ71UI9 128 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC50Q8IVM0 306 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF547Q8IVP9 402 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACOT4Q8N9L9 421 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FNDC5Q8NAU1 212 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1F12Q8NHA8 337 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDXPQ96GD0 296 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF2Q99496 336 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPA33Q99795 319 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOXC2Q99958 501 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF416Q9BWM5 594 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 GBA3Q9H227 469 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELOVL3Q9HB03 270 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CALYQ9NYX4 217 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD84Q9UIB8 345 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMCO1Q9UM00 188 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10H1Q9Y4A9 318 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFNGQ9Y644 331 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 FRMPD3Q5JV73 1810 aa1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CIB4A0PJX0 185 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF233A6NK53 670 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MXQ7 604 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 F5H6K3 240 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 INS-IGF2F8WCM5 200 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN3O15551 220 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RRP8O43159 456 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP5LO75964 103 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRP72O76094 671 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV1D-16P01601 117 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGHV3-43DP0DP04 118 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL12AP29459 219 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 RDXP35241 583 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLRC3Q07444 240 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 VGLL4Q14135 290 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TATDN3Q17R31 274 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTLL9Q3SXZ7 439 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 CARD16Q5EG05 197 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNLZQ5SXM8 178 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCR3LG1Q68D85 454 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLA2G4DQ86XP0 818 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF679Q8IYX0 411 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL10Q8N8L6 244 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 C15orf56Q8N910 161 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 FADS6Q8N9I5 356 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 IPMKQ8NFU5 416 aa1.46□□□□□ -2.18
RNU6-38P-201ENST00000384085 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms