RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381800.3

LOH12CR2-201, Transcript of loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LOH12CR2, Length 1,540 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOH12CR2-201ENST00000381800 FBXW4P57775 412 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 SIRPAP78324 504 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 MXD1Q05195 221 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 PCOLCEQ15113 449 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 NTRK2Q16620 822 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 GXYLT1Q4G148 440 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 MESTQ5EB52 335 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 LCN10Q6JVE6 187 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 XKRXQ6PP77 449 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 ARL9Q6T311 187 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 SSX6Q7RTT6 188 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 SCAIQ8N9R8 606 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 ABHD4Q8TB40 342 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 THAP4Q8WY91 577 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 SMIM19Q96E16 107 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 PELI1Q96FA3 418 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 SOSTQ9BQB4 213 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 TPK1Q9H3S4 243 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 FKBP7Q9Y680 259 aa14.65□□□□□ -0.06
LOH12CR2-201ENST00000381800 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FTCDNL1E5RQL4 147 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 RGS5O15539 181 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FLRT2O43155 660 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 LRRTM2O43300 516 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SEC14L5O43304 696 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TMEM127O75204 238 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 IGHEP01854 428 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 PYCR1P32322 319 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 RIN1Q13671 783 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 EXT1Q16394 746 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 LAX1Q8IWV1 398 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TIGD4Q8IY51 512 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF519Q8TB69 540 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SNX33Q8WV41 574 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ATF6BQ99941 703 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SRRQ9GZT4 340 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ABCB9Q9NP78 766 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FANCFQ9NPI8 374 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 CD8B2A6NJW9 211 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 PHYHO14832 338 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SP9P0CG40 484 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 CD8BP10966 210 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FOXL2P58012 376 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 E2F1Q01094 437 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 HBMQ6B0K9 141 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 M1APQ8TC57 530 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 RNF32Q9H0A6 362 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa14.63□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SHISA3A0PJX4 238 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 PLPP3O14495 311 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SELENOFO60613 162 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SLC19A2O60779 497 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 F13BP05160 661 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 TACSTD2P09758 323 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF28P17035 718 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 MYL9P24844 172 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 GRPRP30550 384 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 MPLP40238 635 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 PTGDSP41222 190 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SNTA1Q13424 505 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ZNF79Q15937 498 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 CDC20BQ86Y33 519 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.62□□□□□ -0.07
LOH12CR2-201ENST00000381800 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms