RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 OR2T5Q6IEZ7 315 aa23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 LINC00471Q8N535 108 aa23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 OR4K5Q8NGD3 323 aa23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 OR2T29Q8NH02 315 aa23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT8Q9NY28 637 aa23.72■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB9A8MZ26 197 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF11BO00300 401 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 SAGP10523 405 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 POU2F1P14859 743 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 MAKP20794 623 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 GRNP28799 593 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 NTF4P34130 210 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 IFNGR2P38484 337 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 SLC9A3P48764 834 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 CASP12Q6UXS9 341 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 ANKK1Q8NFD2 765 aa23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CRIP1-201ENST00000330233 OR6C65A6NJZ3 312 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 C19orf84I3L1E1 186 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 RNF13O43567 381 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 HPRP00739 348 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 CST1P01037 141 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 TSPAN19P0C672 248 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SORDQ00796 357 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 GK3PQ14409 553 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SEC23BQ15437 767 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 Q6ZT83 130 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 OAFQ86UD1 273 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ENKD1Q9H0I2 346 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 REEP1Q9H902 201 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 RCE1Q9Y256 329 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa23.7■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 C11orf98E9PRG8 122 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 LIMS1P48059 325 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN17P56750 224 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 FBXW9Q5XUX1 488 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 UBE2J2Q8N2K1 259 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SPOCK3Q9BQ16 436 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 HDHD5Q9BXW7 423 aa23.69■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 GNGT2O14610 69 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP6O75344 327 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-DOBP13765 273 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 OMPP47874 163 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 FAM27E3Q08E93 113 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 P2RY6Q15077 328 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 NIPAL3Q6P499 406 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 NHLRC1Q6VVB1 395 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 POMGNT2Q8NAT1 580 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 UPB1Q9UBR1 384 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 PRSS50Q9UI38 385 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 HIF3AQ9Y2N7 669 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 PKDREJQ9NTG1 2253 aa23.68■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 C16orf97H3BN30 126 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 OR10H3O60404 316 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 IGFBP2P18065 325 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 GPR4P46093 362 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ERFP50548 548 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 LAPTM4AQ15012 233 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 TAF11Q15544 211 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 GABRG1Q8N1C3 465 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ACBD4Q8NC06 268 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SLCO4A1Q96BD0 722 aa23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PRG6 482 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF432O94892 652 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ADAP00813 363 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 EDNRAP25101 427 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 AQP2P41181 271 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 PRPS1P60891 318 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 CCNIQ14094 377 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ZBED5Q49AG3 693 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35D2Q76EJ3 337 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 OR4C15Q8NGM1 316 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 OR51A7Q8NH64 312 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 NDEL1Q9GZM8 345 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 INIPQ9NRY2 104 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ASB6Q9NWX5 421 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 GPR52Q9Y2T5 361 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa23.66■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF726A6NNF4 738 aa23.65■■□□□ 1.38
CRIP1-201ENST00000330233 CDC42EP2O14613 210 aa23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms