RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 SMIM10Q96HG1 83 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TIMP4Q99727 224 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SCML1Q9UN30 329 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 L7N2F9 121 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 HPXP02790 462 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 RIN1Q13671 783 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SLC35D2Q76EJ3 337 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ZNRF4Q8WWF5 429 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 NKD1Q969G9 470 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 PMEPA1Q969W9 287 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 DDOQ99489 341 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 DIABLOQ9NR28 239 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 C4BPBP20851 252 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CCKBRP32239 447 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 BCORP1Q8N888 145 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ELMOD3Q96FG2 381 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.87■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 DOK2O60496 412 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ECDO95905 644 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CSN2P05814 226 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 MNDAP41218 407 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 HACD4Q5VWC8 232 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SYS1Q8N2H4 156 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 COL4A3Q01955 1670 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 A0A0G2JK05 382 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OR5K3A6NET4 321 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TNFSF14O43557 240 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 RBBP9O75884 186 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 GSG1Q2KHT4 349 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 PCGF3Q3KNV8 242 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TMEM92Q6UXU6 159 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 METTL21AQ8WXB1 218 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TMEM106AQ96A25 262 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SYT4Q9H2B2 425 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 HRASLSQ9HDD0 168 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 A0A1B0GVI7 797 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 GPRIN2O60269 458 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OR7A10O76100 309 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 GPANK1O95872 356 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 IL12BP29460 328 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 DCTDP32321 178 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CCR9P51686 369 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 COMMD7Q86VX2 200 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SCMH1Q96GD3 660 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 GHITMQ9H3K2 345 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 POLE3Q9NRF9 147 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CHRNA9Q9UGM1 479 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 MAB21L2Q9Y586 359 aa16.86■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 A0A0G2JNG1 304 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OR5K4A6NMS3 321 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SPARCP09486 303 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 FAUP35544 74 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 RABIFP47224 123 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OR1D4P47884 311 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SQSTM1Q13501 440 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KCNAB1Q14722 419 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 KIR2DS5Q14953 304 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CDONQ4KMG0 1287 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 C4orf46Q504U0 113 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 ZNF627Q7L945 461 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 LMX1AQ8TE12 382 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 FKRPQ9H9S5 495 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 MSRAQ9UJ68 235 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CTNSO60931 367 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 MPC2O95563 127 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 RAD52P43351 418 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 PXKQ7Z7A4 578 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 OR14A16Q8NHC5 309 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 GPR137Q96N19 417 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 JAM3Q9BX67 310 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TPSD1Q9BZJ3 242 aa16.85■□□□□ 0.29
LRP3-201ENST00000253193 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms