RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055006.11

Trim16-201, Transcript of Tripartite motif-containing protein 16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim16, Length 3,906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim16-201ENSMUST00000055006 P01851 173 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 P01852 173 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Wnt11P48615 354 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Pou3f4P62515 361 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Anxa11P97384 503 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 UradQ283N4 178 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Gm10750Q3V0I0 133 aa7.2□□□□□ -1.26
Trim16-201ENSMUST00000055006 Q5SPV6 233 aa7.2□□□□□ -1.26
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