RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639284.1

CRBN-215, Transcript of cereblon, human

TSL 5 BASIC

Gene CRBN, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRBN-215	ENST00000639284	ZP3	P21754	424 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CDK2	P24941	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HTR4	Q13639	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FAM53B	Q14153	422 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SGTB	Q96EQ0	304 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		H0YGG7	62 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ACOT7	O00154	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RGS11	O94810	467 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PTHLH	P12272	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ADRA2C	P18825	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RUNX3	Q13761	415 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CTNS	O60931	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	IFNA16	P05015	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NMB	P08949	121 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CALCR	P30988	508 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MAP2K6	P52564	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TAS2R20	P59543	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CBFB	Q13951	182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF141	Q15928	474 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PPA2	Q9H2U2	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		A0A087WUJ7	227 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284		L7N2F9	121 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SUSD5	O60279	629 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	UPK3A	O75631	287 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GLCE	O94923	617 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	NAGA	P17050	411 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GPR143	P51810	404 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ART1	P52961	327 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ADPRH	P54922	357 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	EXD3	Q8N9H8	876 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	FAM3C	Q92520	227 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	RASD2	Q96D21	266 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	PRELID1	Q9Y255	219 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	POM121B	A6NF01	834 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GNB5	O14775	395 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	ABHD16A	O95870	558 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CRBN-215	ENST00000639284	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55

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