RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DDO	Q99489	341 aa		11.94	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ARPC3	O15145	178 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZFPL1	O95159	310 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UTS2	O95399	124 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UCHL1	P09936	223 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SRM	P19623	302 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GIF	P27352	417 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CD38	P28907	300 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CCR6	P51684	374 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC37A1	P57057	533 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	EGR4	Q05215	589 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF74	Q16587	644 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GKN2	Q86XP6	184 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SIAH3	Q8IW03	269 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5	9e-8	■■■■□ 24.9
BRF1-222	ENST00000635152	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF576	Q9H609	170 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1B0GTH9	108 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	PIN1P1	O15428	100 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	AKR7A2	O43488	359 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT14	O95848	222 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GPANK1	O95872	356 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ITPKB	P27987	946 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LTB	Q06643	244 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SKP2	Q13309	424 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TEX19	Q8NA77	164 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CA14	Q9ULX7	337 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF264	O43296	627 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	HCRTR2	O43614	444 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	OR2B3	O76000	313 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GLCE	O94923	617 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TACR3	P29371	465 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SOX2	P48431	317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GZMK	P49863	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FOXL2	P58012	376 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZP2	Q05996	745 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GRM7	Q14831	915 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CEP76	Q8TAP6	659 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LPAR4	Q99677	370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.93	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ICOSLG	O75144	302 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	UBL3	O95164	117 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MT-ND4	P03905	459 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GUSB	P08236	651 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CD14	P08571	375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	MYF5	P13349	255 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	CAPZA2	P47755	286 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SERTAD2	Q14140	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	FCN2	Q15485	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
BRF1-222	ENST00000635152	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5

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