RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	PNKD	Q8N490	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PIGX	Q8TBF5	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF121	Q9H920	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PS29	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMA7	O14818	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF264	O43296	627 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GLRA3	O75311	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SAP30	O75446	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF250	P15622	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CD1D	P15813	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PIK3R1	P27986	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NPY4R	P50391	375 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC16A1	P53985	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CORO7	P57737	925 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PDK2	Q15119	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR180	Q86V85	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	VAT1	Q99536	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061		E5RI56	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	IMPA2	O14732	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	EFNA2	O43921	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NDUFS3	O75489	264 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SCEL	O95171	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF205	O95201	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CNIH1	O95406	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	IFNA4	P05014	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CT45A8	P0DMV1	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CT45A9	P0DMV2	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	NR2F6	P10588	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB6A	P20340	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMA3	P25788	255 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CTNNA2	P26232	953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ADM	P35318	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RGS6	P49758	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	KLRD1	Q13241	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RASA2	Q15283	850 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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