RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 HDAC3O15379 428 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 AHSA1O95433 338 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HNF1AP20823 631 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 KDM8Q8N371 416 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ANKK1Q8NFD2 765 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 NUP37Q8NFH4 326 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 PTDSS2Q9BVG9 487 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RAB1BQ9H0U4 201 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 TPT1P8Q9HAU6 139 aa21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0G2JPF8 293 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 TRPC5OSA6NMA1 111 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A3O75751 556 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF432O94892 652 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 TGFAP01135 160 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 PNMTP11086 282 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HGFACQ04756 655 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 EGR4Q05215 589 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A36Q96CQ1 311 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM19Q96HH6 336 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CENPHQ9H3R5 247 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ARMC7Q9H6L4 198 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF442Q9H7R0 627 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RCE1Q9Y256 329 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ANP32DO95626 131 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 IDO1P14902 403 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CBR1P16152 277 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN17P56750 224 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ATG16L1Q676U5 607 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SOX7Q9BT81 388 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 IFT52Q9Y366 437 aa21.61■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 STAMBPO95630 424 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CELA3BP08861 270 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF43P17038 809 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 GIFP27352 417 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 THBS4P35443 961 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RPS5P46782 204 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ARF1P84077 181 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 GTDC1Q4AE62 458 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35B4Q969S0 331 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 VPS33AQ96AX1 596 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 DOK1Q99704 481 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 THAP1Q9NVV9 213 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 B3GAT1Q9P2W7 334 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SEC14L4Q9UDX3 406 aa21.6■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM247A6NEH6 219 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 FZD7O75084 574 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HOXC5Q00444 222 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF311Q5JNZ3 666 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 HHATQ5VTY9 493 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 NXNQ6DKJ4 435 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ITCHQ96J02 903 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 OXGR1Q96P68 337 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 RMND5AQ9H871 391 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 GPR35Q9HC97 309 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 LRP5LA4QPB2 252 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 VSTM5A8MXK1 200 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SLC43A1O75387 559 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 KITP10721 976 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 DAOP14920 347 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 NPR2P20594 1047 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SQLEQ14534 574 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CR1LQ2VPA4 569 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB9Q96C00 473 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 BCL2L10Q9HD36 194 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 ZIM2Q9NZV7 527 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.059e-7■■□□□ 14
PTPRF-216ENST00000617451 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM129A0AVI4 362 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO1B7G3V0H7 640 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRF-216ENST00000617451 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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