RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L4Q9UDX3 406 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM129A0AVI4 362 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SDHDO14521 159 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF21O43680 179 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT75O95678 551 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CBR1P16152 277 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NPR2P20594 1047 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN17P56750 224 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ARF1P84077 181 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA21Q7Z572 469 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA11Q86U17 422 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HPS1Q92902 700 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR45Q9Y5Y3 372 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A096LPI6 279 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RFXANKO14593 260 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF432O94892 652 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 AHSA1O95433 338 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ITGA2P17301 1181 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC74AQ0VAA2 488 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIP10Q15642 601 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG16L1Q676U5 607 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK20Q8IZL9 346 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF786Q8N393 782 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01356Q8N9X3 169 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD8Q8NHS3 518 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 STK35Q8TDR2 534 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A5Q8WUX1 472 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CALML5Q9NZT1 146 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RCE1Q9Y256 329 aa22.18■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3PXD2BA1X283 911 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CRISP3P54108 245 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 EGR4Q05215 589 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NPRL3Q12980 569 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 STX3Q13277 289 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RIN1Q13671 783 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRM1Q16186 407 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNLRB1Q9NP97 96 aa22.17■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF43P17038 809 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CRATP43155 626 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH15P55291 814 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 DSTNP60981 165 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC5Q00444 222 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MDP1Q86V88 176 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CKAP2Q8WWK9 683 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM19Q96HH6 336 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB18Q99592 522 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR35Q9HC97 309 aa22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LYNX1G3V0Z9 82 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TM9SF1O15321 606 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC43A1O75387 559 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LYNX1P0DP58 116 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 BST1Q10588 318 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP2Q14168 576 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM16Q2WEN9 425 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT71Q3SY84 523 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GTDC1Q4AE62 458 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 UBASH3BQ8TF42 649 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TPK1Q9H3S4 243 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NOX3Q9HBY0 568 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.15■■□□□ 1.14
CAPNS1-211ENST00000590874 VSTM5A8MXK1 200 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC14L2O76054 403 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ADRA2AP08913 450 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNGR1P15260 489 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA3P29320 983 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 ARR3P36575 388 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNIQ14094 377 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT80Q6KB66 452 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR137CQ8N3F9 429 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 OXGR1Q96P68 337 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 CRLF2Q9HC73 371 aa22.14■■□□□ 1.13
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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