RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	DTX2	Q86UW9	622 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	PTOV1	Q86YD1	416 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC15	Q8N387	334 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SMYD1	Q8NB12	490 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	EPYC	Q99645	322 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	CGREF1	Q99674	301 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	FKRP	Q9H9S5	495 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	DSCAM	O60469	2012 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	NF1	P21359	2839 aa		8.23	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0B4J2E0	115 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GX12	115 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R082	166 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	TPST2	O60704	377 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC43A1	O75387	559 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SASH3	O75995	380 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	LGI1	O95970	557 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	IGHV4-39	P01824	125 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	C8B	P07358	591 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	BMP4	P12644	408 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	GRPR	P30550	384 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ACVR1B	P36896	505 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	MTPN	P58546	118 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC25A3	Q00325	362 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	LGALS3BP	Q08380	585 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SPOCK1	Q08629	439 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SELPLG	Q14242	412 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	NRF1	Q16656	503 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	DUSP7	Q16829	419 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF544	Q6NX49	715 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	RETREG3	Q86VR2	466 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	OR6S1	Q8NH40	331 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	MCHR1	Q99705	422 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ASPN	Q9BXN1	380 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	REG4	Q9BYZ8	158 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	MRGBP	Q9NV56	204 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	RCE1	Q9Y256	329 aa		8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	8.22	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ROS1	P08922	2347 aa		8.21	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		8.21	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ZFHX3	Q15911	3703 aa		8.21	□□□□□ -1.09
KIFC3-231	ENST00000567479	ARID1A	O14497	2285 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A096LPE4	126 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1W2PPZ6	126 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF223	E7ERA6	249 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A18	H0YCH9	400 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	SSX4	O60224	188 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	FMO6P	O60774	539 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	FZD7	O75084	574 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFS7	O75251	213 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF432	O94892	652 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	ARFIP2	P53365	341 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH12	P55289	794 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNB3	Q05901	458 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	PMS2P3	Q13401	168 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB35	Q15286	201 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	8.21	□□□□□ -1.1
KIFC3-231	ENST00000567479	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	8.21	□□□□□ -1.1

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