RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 SNX18Q96RF0 628 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 SDF2Q99470 211 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 ACER3Q9NUN7 267 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 ASIC5Q9NY37 505 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.4□□□□□ -1.22
PALB2-202ENST00000561514 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PNR3 127 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 WDR91A4D1P6 747 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 RNF212BA8MTL3 300 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 E7EQL1 145 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ABCD4O14678 606 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 KIAA0513O60268 411 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 UGT2B17O75795 530 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TGDSO95455 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 NUDT14O95848 222 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 C6orf47O95873 294 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLC25A16P16260 332 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PRPS1L1P21108 318 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PTAFRP25105 342 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 RRM2P31350 389 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ARRB2P32121 409 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PGM1P36871 562 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SERPINB5P36952 375 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 DIO1P49895 249 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ENTPD1P49961 510 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SSTP61278 116 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 HBA1P69905 142 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 H3F3AP84243 136 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FAPQ12884 760 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TP53BP2Q13625 1128 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SELPLGQ14242 412 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SMU1Q2TAY7 513 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SYT14P1Q58G82 188 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 AGAP6Q5VW22 663 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF544Q6NX49 715 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 LILRB2Q8N423 598 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 S100ZQ8WXG8 99 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TAMM41Q96BW9 452 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MUCL1Q96DR8 90 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 C3orf30Q96M34 536 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 MUS81Q96NY9 551 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 OR7D2Q96RA2 312 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ALG2Q9H553 416 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SP140LQ9H930 580 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 NEK6Q9HC98 313 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 POLE3Q9NRF9 147 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.39□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 DUXAA6NLW8 204 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ANKRD28O15084 1053 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 GPRIN2O60269 458 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 EDF1O60869 148 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 SCN2BO60939 215 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PMS2P2O95744 297 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 PGCP20142 388 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 CD40P25942 277 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 NTF4P34130 210 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 ZNF846Q147U1 533 aa7.38□□□□□ -1.23
PALB2-202ENST00000561514 STK11Q15831 433 aa7.38□□□□□ -1.23
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