RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYND11	Q15326	602 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17	3e-6	■■■■■ 29.8
RBM23-233	ENST00000557667	THEM4	Q5T1C6	240 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	C11orf88	Q6PI97	169 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	NUDT9	Q9BW91	350 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CHST11	Q9NPF2	352 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SUSD5	O60279	629 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	UCHL1	P09936	223 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	BMP4	P12644	408 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF24	P17028	368 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ACHE	P22303	614 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TACR3	P29371	465 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GSK3A	P49840	483 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CDK5R1	Q15078	307 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SSX1	Q16384	188 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	NTRK2	Q16620	822 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-B	Q31612	363 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PATE1	Q8WXA2	126 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PTX4	Q96A99	478 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	OR51E2	Q9H255	320 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	LRRN3	E7EW58	273 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	FAM227A	F5H4B4	570 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GPX5	O75715	221 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	UBL3	O95164	117 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CH25H	O95992	272 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SPI1	P17947	270 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	NPR2	P20594	1047 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CD97	P48960	835 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CRMP1	Q14194	572 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PXK	Q7Z7A4	578 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TPK1	Q9H3S4	243 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667		D6RAR5	112 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	HLA-DMA	P28067	261 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GFER	P55789	205 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PYDC2	Q56P42	97 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	LEG1	Q6P5S2	330 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SGCD	Q92629	289 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	GAREM1	Q9H706	876 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CLPS	P04118	112 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TDGF1	P13385	188 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PRKCA	P17252	672 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	MAOA	P21397	527 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	EPHA2	P29317	976 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SSR4	P51571	173 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CHAF1B	Q13112	559 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667		Q499Y3	187 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RBM23-233	ENST00000557667	TRIM63	Q969Q1	353 aa		7.73	□□□□□ -1.17

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