RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 VRK2Q86Y07 508 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM123Q8N131 208 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CLIP4Q8N3C7 705 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC17Q8N6Y2 441 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR56A1Q8NGH5 318 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR51F2Q8NH61 342 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TWIST2Q8WVJ9 160 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IFT81Q8WYA0 676 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RDH5Q92781 318 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ROPN1LQ96C74 230 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TXNDC15Q96J42 360 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TEX37Q96LM6 180 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WFDC6Q9BQY6 131 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EMC6Q9BV81 110 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RYR2Q92736 4967 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRN3E7EW58 273 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 M0R3G1 203 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC28A1O00337 649 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CFLARO15519 480 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF208O43345 1280 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DNPH1O43598 174 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SYNGR3O43761 229 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 HSPA4LO95757 839 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TSPAN15O95858 294 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GSTA1P08263 222 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MYL2P10916 166 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PNMTP11086 282 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ACHEP22303 614 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PRTN3P24158 256 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PHBP35232 272 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJB13P59910 316 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MYBPC1Q00872 1141 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TGFBR3Q03167 851 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GLO1Q04760 184 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 EPS8Q12929 822 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB39AQ14964 217 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SYT10Q6XYQ8 523 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DOK3Q7L591 496 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SSX8Q7RTT4 187 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DDIASQ8IXT1 998 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SFXN5Q8TD22 340 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM234Q8WY98 164 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MTERF3Q96E29 417 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 OR2M2Q96R28 347 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DUSP26Q9BV47 211 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TXLNGYQ9BZA5 131 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RAB17Q9H0T7 212 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 NPHS2Q9NP85 383 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 DUSP13Q9UII6 198 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RCE1Q9Y256 329 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CMAHPQ9Y471 501 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WDR45Q9Y484 360 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.75□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TENM3Q9P273 2699 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 AGAP5A6NIR3 686 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 MS4A18H0YCH9 400 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 M0R233 179 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 ANKRD28O15084 1053 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 RIPK2O43353 540 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CRCPO75575 148 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 KRT33AO76009 404 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GPANK1O95872 356 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 TFP02787 698 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 GSNP06396 782 aa5.74□□□□□ -1.49
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM157BP0CG42 384 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms