RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537120.5

DDB1-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene DDB1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-208	ENST00000537120	CRYAA	P02489	173 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	PAX7	P23759	505 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	AQP1	P29972	269 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	PRKAR1B	P31321	381 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	CAPZA2	P47755	286 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SPOCK1	Q08629	439 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SCARB2	Q14108	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SQLE	Q14534	574 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	CARTPT	Q16568	116 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	ULK3	Q6PHR2	472 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	VHLL	Q6RSH7	139 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	HDX	Q7Z353	690 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	DTX2	Q86UW9	622 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	HTRA1	Q92743	480 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SLC35B4	Q969S0	331 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	OXGR1	Q96P68	337 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	EPYC	Q99645	322 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	PRR14	Q9BWN1	585 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	ASPN	Q9BXN1	380 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	DNHD1	Q96M86	4753 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-208	ENST00000537120	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ABCA1	O95477	2261 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	PDLIM1	O00151	329 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	UPK3A	O75631	287 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ARAF	P10398	606 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	BMP2	P12643	396 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	GRPR	P30550	384 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TUBA1B	P68363	451 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TUBA4A	P68366	448 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	PMS2P3	Q13401	168 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	OR1Q1	Q15612	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	CYP51A1	Q16850	503 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	CARD17	Q5XLA6	110 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TUBA1A	Q71U36	451 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	UEVLD	Q8IX04	471 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	FAM168A	Q92567	244 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TAAR8	Q969N4	342 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	C12orf10	Q9HB07	376 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	VAPA	Q9P0L0	249 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120		M0R082	166 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120		M0R3G1	203 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	TPST1	O60507	370 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	NPIPB7	O75200	414 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	CRLF1	O75462	422 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	SERPINI2	O75830	405 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	IFNA2	P01563	188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	HIST1H2AB	P04908	130 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-208	ENST00000537120	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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