RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 LAT2Q9GZY6 243 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TESMINQ9Y4I5 508 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GLSO94925 669 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 IFNW1P05000 195 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HPNP05981 417 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PTGDSP41222 190 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC1A3P43003 542 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GSSP48637 474 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 KEAP1Q14145 624 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CDSNQ15517 529 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2A2Q6IF42 318 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 NIPAL3Q6P499 406 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC121Q6ZUS5 278 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ARPINQ7Z6K5 226 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4Z1Q86W10 505 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 NRGNQ92686 78 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CLPTM1LQ96KA5 538 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CDIP1Q9H305 208 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 NANSQ9NR45 359 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC7A7Q9UM01 511 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TENM4Q6N022 2769 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 BBIP1A8MTZ0 92 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 M0R3G1 203 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0513O60268 411 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 EPPINO95925 133 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM107AO95990 144 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GPIP06744 558 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 KLK2P20151 261 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC9A3P48764 834 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GSK3BP49841 420 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CLDN17P56750 224 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 OR1Q1Q15612 314 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 C16orf89Q6UX73 402 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CAMKMTQ7Z624 323 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 OR6T1Q8NGN1 323 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 APH1AQ96BI3 265 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC47A1Q96FL8 570 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ASPNQ9BXN1 380 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 UBQLN3Q9H347 655 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PCSK5Q92824 1860 aa5.85□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 WNK2Q9Y3S1 2297 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A087WZY1 265 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 OR10H3O60404 316 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 FRKP42685 505 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 LHX2P50458 406 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PSPHP78330 225 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PIGFQ07326 219 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CAMK2DQ13557 499 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 FGFBP1Q14512 234 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 DLEU7Q6UYE1 221 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 EPYCQ99645 322 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PCNX3Q9H6A9 2034 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 CDHR4A6H8M9 788 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 C19orf84I3L1E1 186 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 HLA-DQA2P01906 255 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 F13BP05160 661 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 IFI30P13284 250 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 KDELR2P33947 212 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 PTGER4P35408 488 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TUBA1BP68363 451 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 TUBA4AP68366 448 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 MYBPC1Q00872 1141 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 SPIBQ01892 262 aa5.84□□□□□ -1.47
RRN3P1-201ENST00000514813 FUT5Q11128 374 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms