RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 FUZQ9BT04 418 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF426Q9BUY5 554 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CALHM2Q9HA72 323 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf4Q9NR00 106 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 VNN3Q9NY84 501 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SPG11Q96JI7 2443 aa10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MED13LQ71F56 2210 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ARRDC5A6NEK1 342 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CLCA1A8K7I4 914 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SHISA8B8ZZ34 492 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 H3BML4 177 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 EFNA2O43921 213 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 AHSA1O95433 338 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IL18BPO95998 194 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CPN1P15169 458 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GFRA1P56159 465 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 B3GALT5-AS1P59052 145 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ADAM8P78325 824 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SORDQ00796 357 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PRKCDQ05655 676 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MFSD13AQ14CX5 517 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TRIP10Q15642 601 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 BCL2A1Q16548 175 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SYT14P1Q58G82 188 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TBPL2Q6SJ96 375 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 WDR88Q6ZMY6 472 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NRMQ8IXM6 262 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OR6S1Q8NH40 331 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ZPLD1Q8TCW7 415 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NPAS1Q99742 590 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TM9SF2Q99805 663 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PSD2Q9BQI7 771 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TAPBPLQ9BX59 468 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 VCX3BQ9H321 246 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 JKAMPQ9P055 326 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OAZ3Q9UMX2 235 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MTORP42345 2549 aa10.13□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NPIPB7O75200 414 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ATE1O95260 518 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MT-ATP6P00846 226 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H2ABP04908 130 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IFI30P13284 250 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GSTM3P21266 225 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FUT4P22083 530 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 PRKACGP22612 351 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 IDUAP35475 653 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 STARP49675 285 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 UGT2B15P54855 530 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CTBP2P56545 445 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SEC23BQ15437 767 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TAF11Q15544 211 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 FAM69AQ5T7M9 428 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MEIOBQ8N635 442 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf53Q8N6V4 93 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 ATG16L2Q8NAA4 619 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC9Q8WXX5 260 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H2ACQ93077 130 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MBD6Q96DN6 1003 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 BPIFA2Q96DR5 249 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SGTBQ96EQ0 304 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 CIB1Q99828 191 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 SFXN3Q9BWM7 321 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 VCXQ9H320 206 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT8Q9NY28 637 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 TRAPPC4Q9Y296 219 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 NF1P21359 2839 aa10.12□□□□□ -0.79
UBE2B-208ENST00000511807 MED12Q93074 2177 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms