RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NYAP2	Q9P242	653 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ASB3	Q9Y575	518 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305		E9PBE3	544 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	HAS3	O00219	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PALM	O75781	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	IGHD	P01880	384 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	HPGD	P15428	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SLC2A5	P22732	501 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	FMO2	Q99518	471 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PKIB	Q9C010	78 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NPIPB7	O75200	414 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ERLIN2	O94905	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SERPINA3	P01011	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SSX2	Q16385	188 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ARPC1A	Q92747	370 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NRTN	Q99748	197 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305		A0A1B0GUA9	196 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MMP1	P03956	469 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SLC2A3	P11169	496 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ACTR3	P61158	418 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PHF20-215	ENST00000496305	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	INS	P01308	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	MCF2	P10911	925 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	NR2C1	P13056	603 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	ETS2	P15036	469 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	NUDT1	P36639	197 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	CSNK1D	P48730	415 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	CYTH1	Q15438	398 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	DGUOK	Q16854	277 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	FAM110B	Q8TC76	370 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	MYDGF	Q969H8	173 aa		4.02	□□□□□ -1.77
PHF20-215	ENST00000496305	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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