RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 ARHGDIGQ99819 225 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 NELFAQ9H3P2 528 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 PIF1Q9H611 641 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RASD1Q9Y272 281 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ATRQ13535 2644 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CUBNO60494 3623 aa7.26□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A087WUJ7 227 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 E7EQL1 145 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRN3E7EW58 273 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 AIM2O14862 343 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 NDUFS7O75251 213 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SERPINB7O75635 380 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 VAMP5O95183 116 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 HPRP00739 348 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CD8AP01732 235 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 BGLAPP02818 100 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CD247P20963 164 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 PTAFRP25105 342 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 GRPRP30550 384 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 PCGF2P35227 344 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 GZMMP51124 257 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ARFIP2P53365 341 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CDH12P55289 794 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CLDN17P56750 224 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 GUCY1A3Q02108 690 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 LTBQ06643 244 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RBBP4Q09028 425 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 KLF10Q13118 480 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 DUSP7Q16829 419 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RABL3Q5HYI8 236 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM91A1Q658Y4 838 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 REP15Q6BDI9 236 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ULK3Q6PHR2 472 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 DTX2Q86UW9 622 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 POMGNT2Q8NAT1 580 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 OR6T1Q8NGN1 323 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RNF217Q8TC41 542 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC38A4Q969I6 547 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SAR1AQ9NR31 198 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 USP22Q9UPT9 525 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 RCE1Q9Y256 329 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CR1P17927 2039 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 M0QX08 132 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 OR2T1O43869 369 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 FMO6PO60774 539 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 KRT33AO76009 404 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF432O94892 652 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 LYPD3O95274 346 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 LY6G6DO95868 133 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV4-39P01824 125 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 THY1P04216 161 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 HEXAP06865 529 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 VIMP08670 466 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 HLA-DOBP13765 273 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF43P17038 809 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TUBA1BP68363 451 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TUBA4AP68366 448 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TGFBR3Q03167 851 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 VMACQ2NL98 169 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC22A25Q6T423 547 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TUBA1AQ71U36 451 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 SNX32Q86XE0 403 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 CALHM3Q86XJ0 350 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM123Q8N131 208 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN7-208ENST00000494037 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms