RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	SCARB2	Q14108	478 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	REEP3	Q6NUK4	255 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	CUBN	O60494	3623 aa		12.77	□□□□□ -0.36
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CD5L	O43866	347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF43	P17038	809 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	GRPR	P30550	384 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SQLE	Q14534	574 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	KRT73	Q86Y46	540 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC38A4	Q969I6	547 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	NELFA	Q9H3P2	528 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		12.77	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ABCA1	O95477	2261 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618		H7C417	338 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	AIM2	O14862	343 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SEC14L2	O76054	403 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CELA3B	P08861	270 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	NCALD	P61601	193 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CHRNB3	Q05901	458 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CARD17	Q5XLA6	110 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC35B4	Q969S0	331 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OXGR1	Q96P68	337 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	FBN3	Q75N90	2809 aa		12.76	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A096LNT2	108 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	EVPLL	A8MZ36	301 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	TPST2	O60704	377 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC43A1	O75387	559 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF432	O94892	652 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	HPR	P00739	348 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CECR9	P0C854	216 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	HLA-DOB	P13765	273 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	GPX2	P18283	190 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC6A2	P23975	617 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	CALCR	P30988	508 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP4B	P51164	291 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SELPLG	Q14242	412 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OR1Q1	Q15612	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ADRM1	Q16186	407 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SMYD1	Q8NB12	490 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM168A	Q92567	244 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	BOD1	Q96IK1	185 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF607	Q96SK3	696 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	C12orf10	Q9HB07	376 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	GPR35	Q9HC97	309 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.75	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	LRRN3	E7EW58	273 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	MS4A18	H0YCH9	400 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618		M0R3G1	203 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618		M0R3H8	397 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2T1	O43869	369 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	BGLAP	P02818	100 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	OPN1SW	P03999	348 aa		12.74	□□□□□ -0.37
ATG4B-223	ENST00000493618	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37

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