RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ITGA5P08648 1049 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 NCK1P16333 377 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ZNF43P17038 809 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 GGT1P19440 569 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SELENOPP49908 381 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 BEX5Q5H9J7 111 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 NKAIN4Q8IVV8 208 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 SCAIQ8N9R8 606 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 LZICQ8WZA0 190 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST6Q96QI5 342 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 ADA2Q9NZK5 511 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 UPB1Q9UBR1 384 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 RIMS3Q9UJD0 308 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 SERPINA1P01009 418 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R41P59536 307 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A3Q00325 362 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 KRT72Q14CN4 511 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 RNF148Q8N7C7 305 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ASPNQ9BXN1 380 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC19A3Q9BZV2 496 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF432O94892 652 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ZNF682O95780 498 aa18.44■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 STK11Q15831 433 aa18.44■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF74Q16587 644 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 GLYATQ6IB77 296 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NIPAL3Q6P499 406 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MUS81Q96NY9 551 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 A4GNTQ9UNA3 340 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 SNX13Q9Y5W8 968 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CIB4A0PJX0 185 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 OR5H1A6NKK0 313 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PLPP3O14495 311 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CH25HO95992 272 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 THRBP10828 461 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DOBP13765 273 aa18.43■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 RBM34P42696 430 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 UGT2B15P54855 530 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 LGALS3BPQ08380 585 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 C1DQ13901 141 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 IFI44LQ53G44 452 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 C9orf135Q5VTT2 229 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 OR5J2Q8NH18 312 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 NINJ1Q92982 152 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FAM162AQ96A26 154 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PLPPR2Q96GM1 343 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PRRC1Q96M27 445 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CDRT15Q96T59 188 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 CD300AQ9UGN4 299 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 RCE1Q9Y256 329 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
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ACTB-211ENST00000480301 UPK3AO75631 287 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B1P14061 328 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FUT4P22083 530 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 MPGP29372 298 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 IST1P53990 364 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 IL1RL1Q01638 556 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PUDPQ08623 228 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PPA1Q15181 289 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FXNQ16595 210 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PAMR1Q6UXH9 720 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 UEVLDQ8IX04 471 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 LRRC17Q8N6Y2 441 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 FKRPQ9H9S5 495 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 ALPK2Q86TB3 2170 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 OR6C65A6NJZ3 312 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTB-211ENST00000480301 J3KTA2 159 aa18.41■□□□□ 0.54
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