RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF566Q969W8 418 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF570Q96NI8 536 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 FANCFQ9NPI8 374 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.34□□□□□ -1.39
SHQ1-207ENST00000475558 APCP25054 2843 aa6.34□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RIIAD1A6NNX1 92 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CENPBD1B2RD01 187 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LRRTM2O43300 516 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 WDPCPO95876 746 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CH25HO95992 272 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ACTL6AO96019 429 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 HPNP05981 417 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CELA2AP08217 269 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TSPAN19P0C672 248 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CCL3P10147 92 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PRF1P14222 555 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NOS3P29474 1203 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 IDUAP35475 653 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PCYT1AP49585 367 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GABARAPL2P60520 117 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35A1P78382 337 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RELBQ01201 579 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PMS2P3Q13401 168 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 RAPSNQ13702 412 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF74Q16587 644 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 C12orf73Q69YU5 71 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SPINK14Q6IE38 97 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 Q6ZS92 163 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR5J2Q8NH18 312 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SNX18Q96RF0 628 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MBOAT4Q96T53 435 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OR52D1Q9H346 318 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 DKKL1Q9UK85 242 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.33□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 A0A1B0GUH1 482 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 A6NIZ1 184 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PRSS44E7EML9 344 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 GNB5O14775 395 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NME2P1O60361 137 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ZIC3O60481 467 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 ADAM11O75078 769 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 FZD7O75084 574 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TRAPPC6AO75865 159 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 NEURL1O76050 574 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 PMS2P2O95744 297 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 TXNDC12O95881 172 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 LYNP07948 512 aa6.32□□□□□ -1.4
SHQ1-207ENST00000475558 CD14P08571 375 aa6.32□□□□□ -1.4
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