RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.5□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PRG6 482 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 MCIDASD6RGH6 385 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 C11orf98E9PRG8 122 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ARPC2O15144 300 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CGAP01215 116 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FUT1P19526 365 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 KLK2P20151 261 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 H3F3AP84243 136 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PUDPQ08623 228 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SLC17A1Q14916 467 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 MTX3Q5HYI7 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 RINLQ6ZS11 566 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZT83 130 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SSX8Q7RTT4 187 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 OR6N1Q8NGY5 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 OR5J2Q8NH18 312 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 HSD17B8Q92506 261 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 C14orf79Q96F83 325 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FKRPQ9H9S5 495 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PRSS50Q9UI38 385 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CACNA1DQ01668 2161 aa8.49□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 A6NNC1 897 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ENO4A6NNW6 628 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZNF716A6NP11 495 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 NPIPB7O75200 414 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 LYZL6O75951 148 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PDE5AO76074 875 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 UBOX5O94941 541 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 MT-ND1P03886 318 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FABP3P05413 133 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 H1F0P07305 194 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 IFI30P13284 250 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 RHCEP18577 417 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 IFNGR2P38484 337 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PCYT1AP49585 367 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SPIBQ01892 262 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 EGR4Q05215 589 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CHRNB3Q05901 458 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 GUSBP1Q15486 140 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CARD17Q5XLA6 110 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZNF347Q96SE7 839 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SEPHS2Q99611 448 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 C1orf21Q9H246 121 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 CD300AQ9UGN4 299 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 AURKCQ9UQB9 309 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.48□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 FTCDNL1E5RQL4 147 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 PLPP3O14495 311 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 GNGT2O14610 69 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 RAMP1O60894 148 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 OR7A10O76100 309 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 GOSR1O95249 250 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 GADD45GO95257 159 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 BCL10O95999 233 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 BGLAPP02818 100 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 IGFBP2P18065 325 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 RRM2P31350 389 aa8.47□□□□□ -1.05
PKP4-208ENST00000462335 RPL4P36578 427 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms