RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433317.1

TTC28-AS1-212, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 3,080 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GABRA1P14867 456 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL32P24001 234 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GSG1LQ6UXU4 331 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 USP53Q70EK8 1073 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ZNF511Q8NB15 262 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MFRPQ9BY79 579 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.21□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CACNA1CQ13936 2221 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BRINP1O60477 761 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IGF2P01344 180 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAS1P04201 325 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PPP3CBP16298 524 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SPI1P17947 270 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DIO1P49895 249 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DLX5P56178 289 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ERVK-25P63136 954 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C11orf88Q6PI97 169 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 STAC2Q6ZMT1 411 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HAVCR1Q96D42 359 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TSSK2Q96PF2 358 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DUSP22Q9NRW4 184 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR6C65A6NJZ3 312 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SNRPGP15A8MWD9 76 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GPRIN2O60269 458 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CTSVO60911 334 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ADRA2CP18825 462 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LGALS3BPQ08380 585 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 HYAL4Q2M3T9 481 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C17orf107Q6ZR85 190 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 BVESQ8NE79 360 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR4N2Q8NGD1 307 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SERINC2Q96SA4 455 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C14orf105Q9NVL8 296 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MED11Q9P086 117 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TBX21Q9UL17 535 aa13.2□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SULT1B1O43704 296 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 IL5P05113 134 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LINC00271P0C7V0 271 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TPMTP51580 245 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 EID2Q8N6I1 236 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NPEPL1Q8NDH3 523 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR1S1Q8NH92 325 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 Q96M85 177 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DPP7Q9UHL4 492 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SLC22A7Q9Y694 548 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PLATP00750 562 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ARHGDIBP52566 201 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GUCA2AQ02747 115 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FAM53BQ14153 422 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GAS6Q14393 721 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KCNAB1Q14722 419 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PDZD9Q8IXQ8 264 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RAB40AQ8WXH6 277 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MIB2Q96AX9 1013 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 KLF15Q9UIH9 416 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 F5H5P2 479 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 H0YC42 278 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 FGF2P09038 288 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 PRKACAP17612 351 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 SORDQ00796 357 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 GGTLC2Q14390 218 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 CST6Q15828 149 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LRFN4Q6PJG9 635 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 VITQ6UXI7 678 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 OR10G6Q8NH81 332 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TBC1D29Q9UFV1 150 aa13.19□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 TMEM72A0PK05 275 aa13.18□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 RBBP9O75884 186 aa13.18□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 LTBQ06643 244 aa13.18□□□□□ -0.3
TTC28-AS1-212ENST00000433317 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms