RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SGTBQ96EQ0 304 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 DHRS1Q96LJ7 313 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 GALNT8Q9NY28 637 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 RHCGQ9UBD6 479 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 CACNA1CQ13936 2221 aa11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MPDZO75970 2070 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ENO4A6NNW6 628 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MS4A18H0YCH9 400 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 hCG_2039718K7EN88 272 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PLPP3O14495 311 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 OR6A2O95222 327 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 COX6B1P14854 86 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 POU2F1P14859 743 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 NQO1P15559 274 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 FUT1P19526 365 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MAGEA2P43356 314 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 UGT2B15P54855 530 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PRKCDQ05655 676 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 CHRNB3Q05901 458 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PUDPQ08623 228 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZP4Q12836 540 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 C1DQ13901 141 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 FLOT2Q14254 428 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF730Q6ZMV8 503 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 Q6ZT83 130 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 RRM2BQ7LG56 351 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 EPHX4Q8IUS5 362 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 APH1AQ96BI3 265 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SEPHS2Q99611 448 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 OR10A4Q9H209 315 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 C12orf49Q9H741 205 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 POMPQ9Y244 141 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 NOX1Q9Y5S8 564 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 V9GYQ6 96 aa11.48□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 HCFC1P51610 2035 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 A0A087WUU8 490 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 C16orf97H3BN30 126 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 OR7A10O76100 309 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 RAP2AP10114 183 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 IFI30P13284 250 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PPP3CBP16298 524 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SLC9A3P48764 834 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 GK3PQ14409 553 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 FBXW9Q5XUX1 488 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ASRGL1Q7L266 308 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 AAED1Q7RTV5 226 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 UEVLDQ8IX04 471 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 NRMQ8IXM6 262 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PFN4Q8NHR9 129 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SLC7A13Q8TCU3 470 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 KCNN3Q9UGI6 736 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 RCE1Q9Y256 329 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 TMEM5Q9Y2B1 443 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 GPR52Q9Y2T5 361 aa11.47□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 LRRN3E7EW58 273 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 GADD45GO95257 159 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 TSPAN19P0C672 248 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 ADORA3P0DMS8 318 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PTNP21246 168 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 CBLP22681 906 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 NTF4P34130 210 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 UGT2B10P36537 528 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 KIR2DL3P43628 341 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 HMGA2P52926 109 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 FAM27E3Q08E93 113 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SSX8Q7RTT4 187 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa11.46□□□□□ -0.57
HDLBP-210ENST00000423693 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.5 ms