RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ITIH6Q6UXX5 1313 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATP10DQ9P241 1426 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TENM4Q6N022 2769 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CIB4A0PJX0 185 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 C5orf51A6NDU8 294 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR6C65A6NJZ3 312 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CEACAM18A8MTB9 384 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 C12orf71A8MTZ7 269 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 C9JVG2 144 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 G3V4G9 280 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 RASGRF2O14827 1237 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NAPSAO96009 420 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATF6P18850 670 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TBXA2RP21731 343 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 BDH1Q02338 343 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 STXBP2Q15833 593 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF141Q15928 474 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF470Q6ECI4 717 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SCYL2Q6P3W7 929 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NLRP9Q7RTR0 991 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 BNIPLQ7Z465 357 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 OR4A16Q8NH70 328 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 VPS33AQ96AX1 596 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ELMO2Q96JJ3 720 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC68Q9H2F9 335 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF385DQ9H6B1 395 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC30A4O14863 429 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ALOX15BO15296 676 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NDUFB10O96000 172 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 LHBP01229 141 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GH1P01241 217 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ALDOBP05062 364 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CSF3P09919 207 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 PTAFRP25105 342 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GALR1P47211 349 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 VGLL4Q14135 290 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 KYNUQ16719 465 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM69Q5SWH9 247 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 LINC00173Q6ZV60 143 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 MISPQ8IVT2 679 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ABHD3Q8WU67 409 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAPGEF5Q92565 580 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 FGF14Q92915 247 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 HPDLQ96IR7 371 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TSSK3Q96PN8 268 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 RAB17Q9H0T7 212 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 FOLH1BQ9HBA9 442 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GLRX2Q9NS18 164 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC17A7Q9P2U7 560 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 DYSFO75923 2080 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CXCL14O95715 111 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 STARD3NLO95772 234 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GKN3PP0CG01 181 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 PDHBP11177 359 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ARFIP1P53367 373 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 PPP1CBP62140 327 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 HERVK_113P63132 956 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ERVK-8P63133 956 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 RGS1Q08116 209 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SPP2Q13103 211 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 CUL1Q13616 776 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 POU2AF1Q16633 256 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GPRC6AQ5T6X5 926 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ATL3Q6DD88 541 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TBPL2Q6SJ96 375 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM205Q6UW68 189 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 PCGF5Q86SE9 256 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 LINC01561Q8N1V8 128 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SDSLQ96GA7 329 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 NDUFAF3Q9BU61 184 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 C1orf50Q9BV19 199 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ERVK-6Q9BXR3 956 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 TTTY12Q9BZ98 90 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 ISYNA1Q9NPH2 558 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM206AQ9NX38 181 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-959P-201ENST00000384671 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-959P-201ENST00000384671 A8MXE2 369 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-959P-201ENST00000384671 C12orf77C9JDV5 145 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-959P-201ENST00000384671 H0YJW9 148 aa-1.23□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms