RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 UQCRC1P31930 480 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IDUAP35475 653 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR2B6P58173 313 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LTBQ06643 244 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LAPTM4AQ15012 233 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR2A2Q6IF42 318 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CCDC103Q8IW40 242 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 NRMQ8IXM6 262 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 C10orf53Q8N6V4 93 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A36Q96CQ1 311 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZFP3Q96NJ6 502 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KLHL4Q9C0H6 718 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 C12orf49Q9H741 205 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TIGARQ9NQ88 270 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 C20orf141Q9NUB4 165 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TRAPPC4Q9Y296 219 aa11.17□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LIPT2A6NK58 231 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ENO4A6NNW6 628 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LRRN3E7EW58 273 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR2T1O43869 369 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR10H3O60404 316 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CCNB2O95067 398 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PMS2P2O95744 297 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 IFI30P13284 250 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CBLP22681 906 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ASCL1P50553 236 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PRKCDQ05655 676 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GK3PQ14409 553 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR7A5Q15622 319 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MICAQ29983 383 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FAM69AQ5T7M9 428 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MCEMP1Q8IX19 187 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CDK20Q8IZL9 346 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 TAPBPLQ9BX59 468 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CHST11Q9NPF2 352 aa11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 A8MXE2 369 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 AKR7A3O95154 331 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 BGLAPP02818 100 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CRHP06850 196 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PRF1P14222 555 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 FUT1P19526 365 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MAKP20794 623 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PRKACGP22612 351 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 EDNRAP25101 427 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 AGTR1P30556 359 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OMPP47874 163 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ARHGDIAP52565 204 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CTBP2P56545 445 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SLC35A1P78382 337 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RCN1Q15293 331 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF74Q16587 644 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ZER1Q7Z7L7 766 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HS3ST5Q8IZT8 346 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR9Q2Q8NGE9 314 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR6S1Q8NH40 331 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 OR5K1Q8NHB7 308 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PIGXQ8TBF5 258 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GIPC3Q8TF64 312 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 BPIFA2Q96DR5 249 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 SGTBQ96EQ0 304 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MOGAT1Q96PD6 335 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PSD2Q9BQI7 771 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 GALNT8Q9NY28 637 aa11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CNMD-201ENST00000377962 HTR3EA5X5Y0 456 aa11.14□□□□□ -0.63
CNMD-201ENST00000377962 CYTIPO60759 359 aa11.14□□□□□ -0.63
CNMD-201ENST00000377962 OR7A10O76100 309 aa11.14□□□□□ -0.63
CNMD-201ENST00000377962 MT-ATP6P00846 226 aa11.14□□□□□ -0.63
CNMD-201ENST00000377962 IGF2P01344 180 aa11.14□□□□□ -0.63
CNMD-201ENST00000377962 GASTP01350 101 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms