RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 NBR2O15453 112 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RAMP3O60896 148 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ICOSLGO75144 302 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PALMO75781 387 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SCGNO76038 276 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DIRAS1O95057 198 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A27O95847 323 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RSPH10BP0C881 870 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ABOP16442 354 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GSSP48637 474 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CRISP3P54108 245 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 EBI3Q14213 229 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP55Q53EZ4 464 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4F3Q6IEY1 312 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMPD2BQ6IN97 320 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM133AQ8N9E0 248 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ACER1Q8TDN7 264 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 UFD1Q92890 307 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC38A2Q96QD8 506 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CLCC1Q96S66 551 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 YY1AP1Q9H869 796 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SIAEQ9HAT2 523 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IL26Q9NPH9 171 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAPPC4Q9Y296 219 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.37□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CLRN2A0PK11 232 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 HSD17B6O14756 317 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RIPK2O43353 540 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MED7O43513 233 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SNNO75324 88 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RHOBTB1O94844 696 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SFTPCP11686 197 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ADRB3P13945 408 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CMA1P23946 247 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IL12AP29459 219 aa2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
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RABGGTB-202ENST00000370826 HERVK_113P61574 105 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SPIBQ01892 262 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PLD1Q13393 1074 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PSG5Q15238 335 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC152Q4G0S7 254 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP157Q5JU67 520 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ATAD3BQ5T9A4 648 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TSPO2Q5TGU0 170 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF691Q5VV52 312 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf94Q6P1W5 598 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 STEAP2Q8NFT2 490 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 COQ2Q96H96 371 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CAPS2Q9BXY5 557 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PARD6BQ9BYG5 372 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC17A9Q9BYT1 436 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB127Q9H1M4 99 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TMCO1Q9UM00 188 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 ARID1AO14497 2285 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PTCH1Q13635 1447 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A096LNJ9 63 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf71A8MTZ7 269 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf77C9JDV5 145 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 GMFGO60234 142 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 TBPP20226 339 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA9P31269 272 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 RDXP35241 583 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPHP41219 470 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNAR2P48551 515 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 NMUP48645 174 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PAX5Q02548 391 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 MADCAM1Q13477 382 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA0087Q14695 138 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 CYTH1Q15438 398 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGGQ5H8A4 983 aa2.35□□□□□ -2.03
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