RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 CAMK2BQ13554 666 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SELPLGQ14242 412 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GASTP01350 101 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A6P0DMU7 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A5P0DMU8 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A7P0DMV0 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A8P0DMV1 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A9P0DMV2 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MMP12P39900 470 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OPCMLQ14982 345 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC43A2Q8N370 569 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF264O43296 627 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 AIFM1O95831 613 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RPA2P15927 270 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TNFRSF4P43489 277 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GIPRP48546 466 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HBG1P69891 147 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HBG2P69892 147 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 AAED1Q7RTV5 226 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LIPHQ8WWY8 451 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.93□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 A0A1B0GVG6 124 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SMIM14Q96QK8 99 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TSPAN31Q12999 210 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CD207Q9UJ71 328 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HBE1P02100 147 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PDE7AQ13946 482 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLC36A2Q495M3 483 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GATA6Q92908 595 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SHISA4Q96DD7 197 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TMEM212A6NML5 194 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RAB27BO00194 218 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GABRA5P31644 462 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPLD1P80108 840 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GPRIN2O60269 458 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DDAH2O95865 285 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OR10J4P0C629 311 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FOLR1P15328 257 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RABEPKQ7Z6M1 372 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ALG12Q9BV10 488 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NIPAL2Q9H841 368 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DCAF7P61962 342 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LAX1Q8IWV1 398 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CLDN24A6NM45 220 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GABARAPH6UMI1 98 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 GABARAPO95166 117 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 MAKP20794 623 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 SYT9Q86SS6 491 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 CD63P08962 238 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ZNF728P0DKX0 622 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP33O14559 1287 aa14.91□□□□□ -0.02
RXRA-201ENST00000356384 DVL1O14640 695 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms