RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PTTG3PQ9NZH4 202 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF281Q9Y2X9 895 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CDC14CA4D256 554 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRAMEF2O60811 474 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SCGB1D2O95969 90 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IRF4Q15306 451 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 LIPNQ5VXI9 398 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 UBE3DQ7Z6J8 389 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ALG12Q9BV10 488 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HRH4Q9H3N8 390 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 BCL2L10Q9HD36 194 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO4Q9UKT5 387 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SLC6A5Q9Y345 797 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 BRCA2P51587 3418 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IGF2P01344 180 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TAS2R20P59543 309 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CXADRP78310 365 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ARFRP1Q13795 201 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CNKSR3Q6P9H4 555 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SMIM4Q8WVI0 70 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 POTEKPQ9BYX7 375 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IFITM5A6NNB3 132 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NPIPB8E9PQR5 432 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 M0R036 132 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 C21orf58P58505 322 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CDK5R1Q15078 307 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FAM219AQ8IW50 185 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B8Q92506 261 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SYT4Q9H2B2 425 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HCRTR2O43614 444 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SFTPBP07988 381 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TNFRSF17Q02223 184 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 POU4F2Q12837 409 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF584Q8IVC4 421 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FRMD1Q8N878 549 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RADILQ96JH8 1075 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CTNSO60931 367 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ATG12O94817 140 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GPANK1O95872 356 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CD3DP04234 171 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CTSAP10619 480 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 METRNLQ641Q3 311 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PXT1Q8NFP0 134 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR4N2Q8NGD1 307 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 WNT2BQ93097 391 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GPR137Q96N19 417 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SERTM1A2A2V5 107 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00862A6NCI5 91 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 GABARAPH6UMI1 98 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FRKP42685 505 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 MMP15P51511 669 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SMCO1Q147U7 214 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR7A5Q15622 319 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CST6Q15828 149 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 SCARB1Q8WTV0 552 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 PATE1Q8WXA2 126 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM41AQ96HV5 264 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 ACTR10Q9NZ32 417 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0C4DFX4 3053 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 A0A0B4J2A0 478 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 NAP1L6A6NFF2 107 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 I3L1I5 382 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 OR2T7P0C7T2 308 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 IFNGR1P15260 489 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CXCR1P25024 350 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 FUT5Q11128 374 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 RAB11BQ15907 218 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 CLVS2Q5SYC1 327 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM205Q6UW68 189 aa13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms