RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 UPB1Q9UBR1 384 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 CARNS1A5YM72 827 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 URADA6NGE7 173 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 ZNF432O94892 652 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 F3P13726 295 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 PBX2P40425 430 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 CDK5R1Q15078 307 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 CDNFQ49AH0 187 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 FAM219AQ8IW50 185 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 WNT2BQ93097 391 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 KCNK15Q9H427 330 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 GLS2Q9UI32 602 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 NMBP08949 121 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 UGT2B7P16662 529 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 TAS2R20P59543 309 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC35D2Q76EJ3 337 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 FAM46BQ96A09 425 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 SDF2Q99470 211 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 CKLFQ9UBR5 152 aa14.09□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GWA3 101 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 PLPP2O43688 288 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 IGHA1P01876 353 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 PVRP15151 417 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 RAB3AP20336 220 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 DNASE1L1P49184 302 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 DYRK1AQ13627 763 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 PMM1Q92871 262 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 SMIM19Q96E16 107 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 KIF25Q9UIL4 384 aa14.08□□□□□ -0.15
USP25-201ENST00000285679 TPRP12270 2363 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CACNA1DQ01668 2161 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR2W5A6NFC9 320 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CSTAP01040 98 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FAM157BP0CG42 384 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CD34P28906 385 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 P2RX1P51575 399 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TMEM31Q5JXX7 168 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ASPGQ86U10 573 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 NXPE3Q969Y0 559 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 NCDNQ9UBB6 729 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF281Q9Y2X9 895 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GUH1 482 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 XKRYO14609 159 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 IMPA2O14732 288 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 POU4F2Q12837 409 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ERVK-19Q9WJR5 959 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 KNTC1P50748 2209 aa14.08□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CTNNB1P35222 781 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 CTXN1P60606 82 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF85Q03923 595 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 GPAT4Q86UL3 456 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 MARC2Q969Z3 335 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FAM74A7A6NL05 159 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 SEC14L5O43304 696 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 ZNF273Q14593 569 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 TCTN1Q2MV58 587 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.07□□□□□ -0.16
USP25-201ENST00000285679 POMGNT2Q8NAT1 580 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms