RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 H2AFB2P0C5Z0 115 aa16.56■□□□□ 0.24
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PANX1-201ENST00000227638 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 C11orf98E9PRG8 122 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 SIX6O95475 246 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 UCHL1P09936 223 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 DIO1P49895 249 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 GFERP55789 205 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 PER3P56645 1201 aa16.53■□□□□ 0.24
PANX1-201ENST00000227638 SQSTM1Q13501 440 aa16.53■□□□□ 0.24
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