RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan9Q8BJU2 239 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mab21l2Q8BPP1 359 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Muc20Q8BUE7 656 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lyrm4Q8K215 91 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zmynd11Q8R5C8 602 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndc1Q8VCB1 673 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr97Q8VFE1 310 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr516Q8VFZ5 314 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 B3galnt1Q920V1 331 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tada1Q99LM9 335 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MsraQ9D6Y7 233 aa6.1□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Szt2A2A9C3 3431 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp352A2AML7 551 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AI182371A2AS37 356 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc25a25A2ASZ8 469 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1206A2ATJ9 307 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21797J3QNW5 180 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LplP11152 474 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Camk2aP11798 478 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rplp0P14869 317 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mmp2P33434 662 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CtnsP57757 367 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfb2mQ3TL26 396 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd33bQ3U0L2 486 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl2a1bQ497M6 172 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spire1Q52KF3 598 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PfplQ5RKV8 702 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttf1Q62187 859 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CishQ62225 257 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zrsr1Q64707 428 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdh19Q80TF3 1145 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam30Q811Q3 732 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wbp1lQ8BGW2 348 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd46Q8BTZ5 228 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Peli1Q8C669 418 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amdhd2Q8JZV7 409 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eipr1Q8K0G5 386 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mboat2Q8R3I2 519 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1312Q8VF10 317 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr569Q8VGZ2 314 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tktl1Q99MX0 595 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acss1Q99NB1 682 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc5Q9CRA8 235 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Senp8Q9D2Z4 221 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Derl3Q9D8K3 228 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21149A0A0G2JFY7 255 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem156A0A1D5RLR8 321 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hacd4A2AKM2 232 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1234A2AVK5 314 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5286E0CXI6 357 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm15319E9Q637 350 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc38a6G3UVW3 457 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20683H3BKJ1 410 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc30a4O35149 430 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bhlhe40O35185 411 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsd3b6O35469 373 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nipsnap1O55125 284 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01851 173 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01852 173 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LhcgrP30730 700 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FaslgP41047 279 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mapk14P47811 360 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zdhhc2P59267 366 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdk5r1P61809 307 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps11P62281 158 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gch1Q05915 241 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmprss11bQ14C59 416 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ArsgQ3TYD4 525 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnaaf3Q3UYV8 586 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam71f1Q3UZD7 341 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 XkrxQ5GH68 449 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Epha1Q60750 977 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxd3Q61060 465 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 N6amt1Q6SKR2 214 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ube2q1Q7TSS2 422 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scml4Q80VG1 408 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AgmoQ8BS35 447 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl6Q8BVH9 282 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21119Q8C646 350 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mettl7a1Q8C6B0 244 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxo45Q8K3B1 286 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc115Q8VE99 180 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr583Q8VG25 319 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgpra1Q91WW5 304 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrgprb3Q91ZC1 312 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prelid3bQ9CYY7 195 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lcn9Q9D267 178 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam122cQ9D5J5 180 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex44Q9DA60 530 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SmpxQ9DC77 85 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Keg1Q9DCY0 295 aa6.09□□□□□ -1.43
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lypd2Q9DD23 127 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms