RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb25G3UW50 439 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RrhO35214 337 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup3P04939 184 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lemd1Q14C37 129 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp25Q3U435 615 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc30a1Q60738 503 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd4aQ6PDC8 510 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Marveld1Q7TQJ1 173 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Crls1Q80ZM8 303 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpt1cQ8BGD5 798 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ip6k3Q8BWD2 396 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgd2Q8BY35 655 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RfkQ8CFV9 155 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr7a2Q8CG76 367 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ubqln1Q8R317 582 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr881Q8VF63 314 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr763Q8VGC1 309 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar1Q923Y8 332 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Otub2Q9CQX0 234 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rita1Q9D1H0 253 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ApmapQ9D7N9 415 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spaca1Q9DA48 305 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc46a3Q9DC26 460 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sorcs2Q9EPR5 1159 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il17bQ9QXT6 180 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw5Q9QXW2 573 aa11.65□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncor1Q60974 2453 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm13178B1AVU7 408 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r14H3BJ46 303 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrnb1P09690 501 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sstr2P30875 369 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bglap3P54615 95 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csn1s2aQ02862 184 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcst1Q059Y8 732 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3U6N9 222 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr684Q7TRN8 312 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr70Q80ZX9 316 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd11Q8BJ51 449 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TifabQ8JZM6 147 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gatad2bQ8VHR5 594 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abhd17aQ99JW1 310 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gorasp2Q99JX3 451 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnk1Q99ML2 666 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700029P11RikQ9CQ68 150 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspan31Q9CQ88 210 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931417E11RikQ9CR05 305 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Natd1Q9DBW3 110 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard5Q9EPQ7 213 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ulk2Q9QY01 1037 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim3Q9R1R2 744 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NcdnQ9Z0E0 729 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpeg1A1L314 713 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LexmA2AVQ5 414 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 I0C0044D17RikA6PWL3 169 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd209fD3Z1H5 274 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr723E9PZU2 309 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr137cE9Q343 423 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr724K7N5X7 309 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NgpO08692 167 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasd1O35626 280 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lancl1O89112 399 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxa2P31245 372 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RykQ01887 594 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tamm41Q3TUH1 337 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf149Q3U2C5 394 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nhlrc4Q3UP44 136 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gnt6Q3USF0 391 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Surf4Q64310 269 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SpicQ6P3D7 242 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5346Q7M766 736 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpina3fQ80X76 445 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lix1lQ8BQ89 337 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp15Q8C7V3 528 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1512Q8VF72 313 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr768Q8VGC4 312 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pycr1Q922W5 309 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ucn3Q924A4 164 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt22Q9DD16 308 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndrg3Q9QYF9 375 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa11.64□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fer1l4A3KGK3 1992 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700025B11RikA0A087WNZ6 93 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zyg11aA2BFL2 627 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm266A6H634 200 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm43720E0CXM8 267 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem44E9Q4M0 433 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp141G3UY09 685 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp619G3X9T2 1161 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem200cJ3QK46 637 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3755K7N743 167 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angpt1O08538 498 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VipP32648 170 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FaslgP41047 279 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Evx2P49749 475 aa11.63□□□□□ -0.55
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2zQ3UE37 356 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.3 ms