RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX2P50458 406 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL26Q53HC5 615 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A6Q6NXT4 461 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZAR1Q86SH2 424 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 PARP8Q8N3A8 854 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG16L2Q8NAA4 619 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF555Q8NEP9 628 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FEVQ99581 238 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TM9SF2Q99805 663 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MGAT4BQ9UQ53 548 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TPST2O60704 377 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 STARP49675 285 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CHN2P52757 468 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFBP1Q14512 234 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF440Q8IYI8 595 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 OMA1Q96E52 524 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MBOAT4Q96T53 435 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 HCRTR2O43614 444 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP7B1O75881 506 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TGM6O95932 706 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAP00813 363 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TBXA2RP21731 343 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CBLP22681 906 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 PNLIPRP2P54317 469 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN18P56856 261 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SRYQ05066 204 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 GANABQ14697 944 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAM2Q15035 370 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF550Q7Z398 422 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP54Q7Z3B4 507 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF527Q8NB42 609 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52J3Q8NH60 311 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 Q96MF0 132 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MCHR1Q99705 422 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 DGCR6LQ9BY27 220 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGMQ9H3S5 423 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT84Q9NSB2 600 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 RLIMQ9NVW2 624 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 WIF1Q9Y5W5 379 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PNV4 684 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3PXD2BA1X283 911 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SERINC4A6NH21 518 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM171A2A8MVW0 826 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF9O43307 516 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 LOXP28300 417 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CCKARP32238 428 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM27E3Q08E93 113 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 COX10Q12887 443 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SNTA1Q13424 505 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A13Q8TCU3 470 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CYGBQ8WWM9 190 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC38A4Q969I6 547 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CNBD2Q96M20 576 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF17Q9P2E2 1029 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.58■■□□□ 1.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 CBR3O75828 277 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LYNP07948 512 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF708P17019 499 aa21.58■■□□□ 1.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 PCYT1AP49585 367 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R41P59536 307 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF613Q6PF04 617 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS57Q6UWY2 283 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGN2P46Q86SG4 172 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LSMEM1Q8N8F7 131 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4C3Q8NH37 302 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF138Q8WVD3 245 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL2Q9UKC9 423 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ROS1P08922 2347 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RTTNQ86VV8 2226 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PQD3 144 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM64A6NGJ6 449 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM64BA6NI03 449 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN24A6NM45 220 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SMPD2O60906 423 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB7O75027 752 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK6P29122 969 aa21.57■■□□□ 1.04
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