RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 CLUP10909 449 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CTNNB1P35222 781 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PTH2RP49190 550 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PRKAG1P54619 331 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PFN3P60673 137 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RAB2AP61019 212 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SREBF2Q12772 1141 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KRT33BQ14525 404 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PON3Q15166 354 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TEAD2Q15562 447 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RNF212Q495C1 297 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC8B1Q6J4K2 584 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GAREM2Q75VX8 874 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ATG101Q9BSB4 218 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL31Q9H511 634 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 XKR8Q9H6D3 395 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PISDQ9UG56 409 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PPH5 198 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PSMD9O00233 223 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SOCS5O75159 536 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC16A8O95907 504 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ABOP16442 354 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HTR2AP28223 471 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EFNB1P98172 346 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 BEST3Q8N1M1 668 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMED6Q8WW62 240 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ALG14Q96F25 216 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 LURAP1Q96LR2 239 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM68Q96MH6 324 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 OR14A2Q96R54 314 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 UCN2Q96RP3 112 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WV48 116 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF879B4DU55 563 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FLRT2O43155 660 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TSPAN6O43657 245 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TXNDC12O95881 172 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CATP04040 527 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CD2P06729 351 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 IL3P08700 152 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CPN1P15169 458 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MGMTP16455 207 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ACTR1BP42025 376 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC6A12P48065 614 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PCP4P48539 62 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GUCA2AQ02747 115 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CBFBQ13951 182 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TP53I3Q53FA7 332 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FAM69AQ5T7M9 428 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ACBD7Q8N6N7 88 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 MISP3Q96FF7 219 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SAMD8Q96LT4 415 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 TIMP4Q99727 224 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ARGFXA6NJG6 315 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 ACOD1A6NK06 481 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRT-211ENST00000618610 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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