RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610726.4

CSDE1-218, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSDE1, Length 4,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-218ENST00000610726 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GHSRQ92847 366 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 RADILQ96JH8 1075 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 POLHQ9Y253 713 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 R4GN57 208 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SDK2Q58EX2 2172 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PTPRFP10586 1907 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 RLFQ13129 1914 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CDHR4A6H8M9 788 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GABRPO00591 440 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 AKR7A3O95154 331 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PITPNBP48739 271 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CYB561P49447 251 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PRKCDQ05655 676 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 AGERQ15109 404 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 STK11Q15831 433 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 NTRK2Q16620 822 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OR4C3Q8NH37 302 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF566Q969W8 418 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 FAM46BQ96A09 425 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 EDEM2Q9BV94 578 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CHRDQ9H2X0 955 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 KCND3Q9UK17 655 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GGT3PA6NGU5 568 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 M0R082 166 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OR2J2O76002 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 DDAH2O95865 285 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CD46P15529 392 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 MPLP40238 635 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CCL11P51671 97 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SELENOVP59797 346 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SPOCK1Q08629 439 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 MALLQ13021 153 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 AWAT2Q6E213 333 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 XKRXQ6PP77 449 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 KCTD9Q7L273 389 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GRINAQ7Z429 371 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OR1L3Q8NH93 324 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ELP5Q8TE02 316 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 HHLA2Q9UM44 414 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.69□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OTOFQ9HC10 1997 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 ISPDA4D126 451 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OR7A10O76100 309 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 MPIG6BO95866 241 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CLUP10909 449 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 HTR1FP30939 366 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 TNFSF8P32971 234 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 GRK5P34947 590 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 EMDP50402 254 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CLDN12P56749 244 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 E2F1Q01094 437 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 P2RY14Q15391 338 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 NDUFA5Q16718 116 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 CDNFQ49AH0 187 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OTPQ5XKR4 325 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 OR5J2Q8NH18 312 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SPTSSAQ969W0 71 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 TEAD3Q99594 435 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 SLC6A7Q99884 636 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.68□□□□□ -1.34
CSDE1-218ENST00000610726 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms