RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606884.1

GMDS-AS1-215, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TMCO1Q9UM00 188 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DTNAQ9Y4J8 743 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.46□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM159BA6NKW6 160 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PIAS1O75925 651 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LGI1O95970 557 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KRT6AP02538 564 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KRT6BP04259 564 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CSF1P09603 554 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ALOX5P09917 674 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 UBL4AP11441 157 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PAFAH1B1P43034 410 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ALDH3B1P43353 468 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KRT6CP48668 564 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SEC24CP53992 1094 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ATP12AP54707 1039 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LCN2P80188 198 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MVKQ03426 396 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MERTKQ12866 999 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DOC2BQ14184 412 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZSCAN26Q16670 478 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM209AQ5JX71 171 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCNJQ5T5M9 372 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AVPI1Q5T686 147 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRTP1Q5TC63 336 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KRT80Q6KB66 452 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 C8orf74Q6P047 294 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CMIPQ8IY22 773 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PARP8Q8N3A8 854 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TIMD4Q96H15 378 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GPR78Q96P69 363 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GAL3ST1Q99999 423 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM107BQ9H098 131 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NOX4Q9NPH5 578 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF225Q9UK10 706 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SNX24Q9Y343 169 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.45□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AGAP5A6NIR3 686 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 C17orf100A8MU93 164 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MANBAO00462 879 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NR5A2O00482 541 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLHL2O95198 593 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM153BP0C7A2 387 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TFPIP10646 304 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF35P13682 527 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ATP6V1C1P21283 382 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RAD52P43351 418 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MAP2K6P52564 334 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SLC35A1P78382 337 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HSPB3Q12988 150 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LCP2Q13094 533 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM153CQ494X1 144 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLC3Q6P597 504 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LINGO2Q7L985 606 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AAED1Q7RTV5 226 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRINAQ7Z429 371 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RELL1Q8IUW5 271 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ST7LQ8TDW4 575 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 JADE3Q92613 823 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DYRK2Q92630 601 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RAB1CQ92928 201 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RAB8BQ92930 207 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 UPRTQ96BW1 309 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 APIPQ96GX9 242 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SH3GL3Q99963 347 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SYT3Q9BQG1 590 aa6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MRI1Q9BV20 369 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms