RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 GPAT4Q86UL3 456 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ELOA3Q8NG57 546 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 MFSD8Q8NHS3 518 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 BBS10Q8TAM1 723 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ADPRHL2Q9NX46 363 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 RASD1Q9Y272 281 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ATP23Q9Y6H3 246 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 CLIC1O00299 241 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 AHSA1O95433 338 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 PAX7P23759 505 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 SELENOPP49908 381 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 EGR4Q05215 589 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 RAB35Q15286 201 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 EPHX4Q8IUS5 362 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 TMEM45AQ9NWC5 275 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ATRQ13535 2644 aa15.97■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ETS2P15036 469 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 SLC25A16P16260 332 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 CHRNB3Q05901 458 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 LRIF1Q5T3J3 769 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 LINGO2Q7L985 606 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 MAL2Q969L2 176 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 C7orf26Q96N11 449 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 C12orf10Q9HB07 376 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 GMEB1Q9Y692 573 aa15.96■□□□□ 0.15
CTIF-206ENST00000588345 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 GPRIN2O60269 458 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 LGI1O95970 557 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 PNMTP11086 282 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 BMP4P12644 408 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 PRKAR1BP31321 381 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 EFNA4P52798 201 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 MSRB3Q8IXL7 192 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 ZNF525Q8N782 197 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 HTRA1Q92743 480 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 MOKQ9UQ07 419 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 RCE1Q9Y256 329 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 RTTNQ86VV8 2226 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 COL6A5A8TX70 2615 aa15.95■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 ERLIN1O75477 346 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 UPK3AO75631 287 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 KRT33AO76009 404 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 TGDSO95455 350 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 STX1BP61266 288 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 VLDLRP98155 873 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 HOXC5Q00444 222 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 LGALS3BPQ08380 585 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 MST1LQ2TV78 715 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 NIPAL3Q6P499 406 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 SLC38A2Q96QD8 506 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 NELFAQ9H3P2 528 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.94■□□□□ 0.14
CTIF-206ENST00000588345 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms