RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585363.5

NEDD4L-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 241 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-211	ENST00000585363	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PANX1	Q96RD7	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MED17	Q9NVC6	651 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	HAO1	Q9UJM8	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363		A0A1W2PNR3	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363		A0A1W2PR80	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	HMGN4	O00479	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SCD	O00767	359 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	AP3D1	O14617	1153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	TNFSF11	O14788	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RAD51D	O75771	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ANP32D	O95626	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	NGF	P01138	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CHRM4	P08173	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ANPEP	P15144	967 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SELE	P16581	610 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	UQCRC2	P22695	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CRAT	P43155	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	GYS2	P54840	703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	HOXC5	Q00444	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	IL1RL1	Q01638	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	AGK	Q53H12	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	C10orf111	Q8N326	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MIER2	Q8N344	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MAL2	Q969L2	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SDF2	Q99470	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ZBTB18	Q99592	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PIGU	Q9H490	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PIF1	Q9H611	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	NTM	Q9P121	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363		A0A0G2JND7	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363		A0A0J9YW62	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	LCE6A	A0A183	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	RFXANK	O14593	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	UGT2B17	O75795	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SEC14L2	O76054	403 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	SLITRK5	O94991	958 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	MPZL1	O95297	269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	H6PD	O95479	791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEDD4L-211	ENST00000585363	OPN1MW	P04001	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms