RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MMP21	Q8N119	569 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	COX18	Q8N8Q8	333 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OTULIN	Q96BN8	352 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MYADM	Q96S97	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SDF2	Q99470	211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	FGF22	Q9HCT0	170 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NCN8	305 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	POM121B	A6NF01	834 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YGG7	62 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	BTN3A3	O00478	584 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CASK	O14936	926 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	AQP9	O43315	295 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	OR10H2	O60403	315 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CTNS	O60931	367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCC2	O75069	709 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF217	O75362	1048 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TPPP	O94811	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NKX2-2	O95096	273 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	CDRT1	O95170	752 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SOX14	O95416	240 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA4F	O95754	770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ALPPL2	P10696	532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MYOG	P15173	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	UGT2B7	P16662	529 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF3	P17036	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5E	P21589	574 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC6A6	P31641	620 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	TALDO1	P37837	337 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	GNAL	P38405	381 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRM-215	ENST00000583289	ETV5	P41161	510 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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