RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 EPYCQ99645 322 aa15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 BDH2Q9BUT1 245 aa15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa15.99■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1B0GWA3 101 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 DPRXA6NFQ7 191 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 FTCDNL1E5RQL4 147 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 FMO6PO60774 539 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 MFN2O95140 757 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 P2RY4P51582 365 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ARFIP2P53365 341 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 HOXC5Q00444 222 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 MAPRE2Q15555 327 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RETREG3Q86VR2 466 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 DEPDC4Q8N2C3 294 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZIC4Q8N9L1 334 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.98■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TLN2Q9Y4G6 2542 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 BBIP1A8MTZ0 92 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 AIM2O14862 343 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TPST1O60507 370 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 KRT33AO76009 404 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ITGA5P08648 1049 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PTH2RP49190 550 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 EGR4Q05215 589 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PTOV1Q86YD1 416 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ANKK1Q8NFD2 765 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PERPQ96FX8 193 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 MED4Q9NPJ6 270 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RCE1Q9Y256 329 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 A0A087WUJ7 227 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 LGI1O95970 557 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 WNT11O96014 354 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 DANCRP0C864 163 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF43P17038 809 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 HTR2AP28223 471 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 OR1Q1Q15612 314 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ETFDHQ16134 617 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 OXGR1Q96P68 337 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 SLC17A5Q9NRA2 495 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.96■□□□□ 0.15
COMMD4-218ENST00000567377 VPS13CQ709C8 3753 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 A0A0B4J2E0 115 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1B0GX12 115 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 M0QX08 132 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ABCD4O14678 606 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 INHBBP09529 407 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 AQP1P29972 269 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PCGF2P35227 344 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MTPNP58546 118 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 PRPS1P60891 318 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 DMTNQ08495 405 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 MMEL1Q495T6 779 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF613Q6PF04 617 aa15.95■□□□□ 0.14
COMMD4-218ENST00000567377 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms