RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 MED18Q9BUE0 208 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 BCO1Q9HAY6 547 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RASSF1Q9NS23 344 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 A0A1W2PPR1 153 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LRRN3E7EW58 273 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LYZL6O75951 148 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 THY1P04216 161 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 GPIP06744 558 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 THBDP07204 575 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 OR1E2P47887 323 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 OR3A2P47893 321 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NUDT2P50583 147 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CDH12P55289 794 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NCALDP61601 193 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 H3F3AP84243 136 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NRF1Q16656 503 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 GPAT4Q86UL3 456 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 STK32CQ86UX6 486 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CDC20BQ86Y33 519 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 GABRG1Q8N1C3 465 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 UBE2J2Q8N2K1 259 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TAAR8Q969N4 342 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 DACH2Q96NX9 599 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PTDSS2Q9BVG9 487 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TRIM2Q9C040 744 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TMEM27Q9HBJ8 222 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TRAPPC4Q9Y296 219 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.27□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NOTCH2Q04721 2471 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 A0A0B4J2E0 115 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GX12 115 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 FAM221AA4D161 298 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ZNF724A8MTY0 619 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 FAM220BPB1ANY3 271 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NME4O00746 187 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SLC22A2O15244 555 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NPIPB7O75200 414 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 AHSA1O95433 338 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NPPAP01160 153 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 HRGP04196 525 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 NCK1P16333 377 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 IGHV1-2P23083 117 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PEX19P40855 299 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 P2RY4P51582 365 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SLC7A2P52569 658 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LIPEQ05469 1076 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LTBQ06643 244 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LGALS3BPQ08380 585 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SLC17A1Q14916 467 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ENTPD8Q5MY95 495 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 TMEM225Q6GV28 225 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ULK3Q6PHR2 472 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CASP12Q6UXS9 341 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CCDC80Q76M96 950 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CDH24Q86UP0 819 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 CARM1Q86X55 608 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 MICU2Q8IYU8 434 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 RNF148Q8N7C7 305 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 OR2T12Q8NG77 320 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 PIGXQ8TBF5 258 aa7.26□□□□□ -1.25
LINS1-211ENST00000560941 STK35Q8TDR2 534 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms