RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 GCKP35557 465 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 IDH2P48735 452 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 FOXF1Q12946 379 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PGGHGQ32M88 737 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GLYATQ6IB77 296 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ENPP6Q6UWR7 440 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ZNF563Q8TA94 476 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 FNDC9Q8TBE3 224 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TMEM234Q8WY98 164 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ARHGDIGQ99819 225 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 WFDC6Q9BQY6 131 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SHARPINQ9H0F6 387 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GORASP2Q9H8Y8 452 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ELOVL5Q9NYP7 299 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SLC13A4Q9UKG4 626 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 BAG5Q9UL15 447 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ZNF337Q9Y3M9 751 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 EFNA2O43921 213 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ELK4P28324 431 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SLC1A3P43003 542 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 RASSF2P50749 326 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SELENOWP63302 87 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 HOXC5Q00444 222 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 BNIP2Q12982 314 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 BCL2A1Q16548 175 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 STAC2Q6ZMT1 411 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 KBTBD8Q8NFY9 601 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PROX1Q92786 737 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 FAM162AQ96A26 154 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 THTPAQ9BU02 230 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ADAM19Q9H013 955 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PCDHAC1Q9H158 963 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ADPRHL2Q9NX46 363 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SNX13Q9Y5W8 968 aa12.23□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ERICH4A6NGS2 130 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 M0R3H8 397 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 EBAG9O00559 213 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ARPC2O15144 300 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TPST2O60704 377 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GMNNO75496 209 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PDE5AO76074 875 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 AQP8O94778 261 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SERPINA1P01009 418 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 IGHV4-31P0DP07 118 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SRD5A1P18405 259 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 IL11P20809 199 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ME2P23368 584 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 HTR2AP28223 471 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 RAC1P63000 192 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 MERTKQ12866 999 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 NPTX1Q15818 432 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 WBP2NLQ6ICG8 309 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CBLL1Q75N03 491 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GRINAQ7Z429 371 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 LSMEM1Q8N8F7 131 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 OR52E4Q8NGH9 312 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PROCRQ9UNN8 238 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 AP4B1Q9Y6B7 739 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 H3BML4 177 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GSC2O15499 205 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 SEC14L5O43304 696 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 FMO6PO60774 539 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ZNF682O95780 498 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PEPDP12955 493 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TNFRSF1BP20333 461 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 HTR3AP46098 478 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 COPZ1P61923 177 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PGM2L1Q6PCE3 622 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 GGNQ86UU5 652 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 LILRA2Q8N149 483 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 LZICQ8WZA0 190 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TPD52L3Q96J77 140 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 PRR14Q9BWN1 585 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 TRIM2Q9C040 744 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ACTR6Q9GZN1 396 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 LRMDAQ9H2I8 198 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 MUC13Q9H3R2 512 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
CS-231ENST00000552222 CTPS2Q9NRF8 586 aa12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms