RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PXK	Q7Z7A4	578 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ASB15	Q8WXK1	588 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TGM7	Q96PF1	710 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM19	Q9H013	955 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	FKRP	Q9H9S5	495 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IL17B	Q9UHF5	180 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442		V9GYH0	126 aa		10.8	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF879	B4DU55	563 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PDCD5	O14737	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	HCRTR1	O43613	425 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR2T1	O43869	369 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PIP5K1C	O60331	668 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	GLCE	O94923	617 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	DLGAP3	O95886	979 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CD14	P08571	375 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	MAOB	P27338	520 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RFX3	P48380	749 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CDON	Q4KMG0	1287 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	KLHL12	Q53G59	568 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CADM3	Q8N126	398 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR8K3	Q8NH51	312 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PFN4	Q8NHR9	129 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SMPDL3B	Q92485	455 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	NANS	Q9NR45	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	STARD5	Q9NSY2	213 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SOCS6	O14544	535 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SC5D	O75845	299 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SNAPC5	O75971	98 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IGKV1D-16	P01601	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RAF1	P04049	648 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKAR1A	P10644	381 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IL7	P13232	177 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	IL12B	P29460	328 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SDHA	P31040	664 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TGFBR1	P36897	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PGD	P52209	483 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	UCN	P55089	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	DLX5	P56178	289 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	TMPRSS3	P57727	454 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB25	P57735	213 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC26A5	P58743	744 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1CA	P62136	330 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SIRPA	P78324	504 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	SKP2	Q13309	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LETMD1-223	ENST00000550442	DNASE1L3	Q13609	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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