RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 HPS1Q92902 700 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 BTBD2Q9BX70 525 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CRLF2Q9HC73 371 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EXD2Q9NVH0 621 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF639Q9UID6 485 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HSPB2A8KAH6 182 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 INAFM1C9JVW0 142 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TPPPO94811 219 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF682O95780 498 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LGI1O95970 557 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CD79AP11912 226 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CD99P14209 185 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CD247P20963 164 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RCVRNP35243 200 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OPRM1P35372 400 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ATP12AP54707 1039 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CDH15P55291 814 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CLDN8P56748 225 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 DNAJB13P59910 316 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EMX2Q04743 252 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NFYCQ13952 458 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EFR3AQ14156 821 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 17.3
CS-212ENST00000548567 HSPB2Q16082 182 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MTFR2Q6P444 385 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 COMTD1Q86VU5 262 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PGAM4Q8N0Y7 254 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EID3Q8N140 333 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MED30Q96HR3 178 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF347Q96SE7 839 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PIGUQ9H490 435 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ALG2Q9H553 416 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SIAEQ9HAT2 523 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RASSF1Q9NS23 344 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PRELID1Q9Y255 219 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 A6NNC1 897 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 H3BSH0 61 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 H7C1C5 153 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLC22A2O15244 555 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ACOX3O15254 700 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NPHS1O60500 1241 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 KRT75O95678 551 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SOD3P08294 240 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 EPXP11678 715 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HSD3B1P14060 373 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HSD3B2P26439 372 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SELENOPP49908 381 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TMBIM6P55061 237 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LCN6P62502 163 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SELENBP1Q13228 472 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GGTLC2Q14390 218 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SYT14P1Q58G82 188 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 Q5PR19 223 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 NIPAL3Q6P499 406 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 STK32CQ86UX6 486 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.341e-10■■□□□ 11.5
CS-212ENST00000548567 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PP18 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 OR6C76A6NM76 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GMNNO75496 209 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CLPXO76031 633 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 INMTO95050 263 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 BCL10O95999 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 IGHG3P01860 377 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 HLA-HP01893 362 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 FAM157BP0CG42 384 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 ZNF708P17019 499 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 MYF6P23409 242 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 CCKARP32238 428 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 IFITM2Q01629 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 BSPH1Q075Z2 132 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 TFF3Q07654 80 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 FUT5Q11128 374 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 FGD3Q5JSP0 725 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 GPR107Q5VW38 600 aa6.69□□□□□ -1.34
CS-212ENST00000548567 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.69□□□□□ -1.34
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