RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 ZNF43P17038 809 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CD40P25942 277 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 IL1RL1Q01638 556 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NEUROG1Q92886 237 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC38A4Q969I6 547 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MAGEB18Q96M61 343 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 DHRS9Q9BPW9 319 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.87□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PR80 420 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SHISA9B4DS77 424 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ANGPT2O15123 496 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TP53P04637 393 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ITGA5P08648 1049 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CDKN1AP38936 164 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FABP6P51161 128 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CHRNB3Q05901 458 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SCARB2Q14108 478 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TTMPQ5BVD1 217 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 HIPK4Q8NE63 616 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 STON2Q8WXE9 905 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 EPYCQ99645 322 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MRGBPQ9NV56 204 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.86□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 AIM2O14862 343 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NTF4P34130 210 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 HOXC5Q00444 222 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CYP51A1Q16850 503 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PGGHGQ32M88 737 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZNF544Q6NX49 715 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NIPAL3Q6P499 406 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ULK3Q6PHR2 472 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CREB3L2Q70SY1 520 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 DTX2Q86UW9 622 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ARMC8Q8IUR7 673 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 VAPAQ9P0L0 249 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 GMEB1Q9Y692 573 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 VPS13CQ709C8 3753 aa14.85□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PDLIM1O00151 329 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 NPIPB7O75200 414 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC43A1O75387 559 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 GPX2P18283 190 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TTKP33981 857 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TNK1Q13470 666 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RAB35Q15286 201 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 MUC15Q8N387 334 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 LSMEM1Q8N8F7 131 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TSPEARQ8WU66 669 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 OXGR1Q96P68 337 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ASPNQ9BXN1 380 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.84□□□□□ -0.03
CASP9-211ENST00000546969 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa14.83□□□□□ -0.04
CASP9-211ENST00000546969 A0A1B0GWA3 101 aa14.83□□□□□ -0.04
CASP9-211ENST00000546969 VSTM5A8MXK1 200 aa14.83□□□□□ -0.04
CASP9-211ENST00000546969 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CASP9-211ENST00000546969 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms