RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527497.1

NXF1-205, Transcript of nuclear RNA export factor 1, human

TSL 2

Gene NXF1, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXF1-205	ENST00000527497	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	MLX	Q9UH92	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CENPX	A8MT69	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497		B4DXG7	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497		F8VZ95	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497		G3V2L1	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ERLIN2	O94905	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	KLHL2	O95198	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	IGHG1	P01857	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	C2	P06681	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CD55	P08174	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	DDOST	P39656	456 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NR4A2	P43354	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	EFNA3	P52797	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	FBXW4	P57775	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	DSCR9	P59020	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	STX3	Q13277	289 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	IL18R1	Q13478	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PIGU	Q9H490	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497		A0A087WW49	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	GFY	I3L273	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SULT2B1	O00204	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	RFXANK	O14593	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	GPAA1	O43292	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	GMDS	O60547	372 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	VAPB	O95292	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PDHA2	P29803	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLC26A3	P40879	764 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	GPR1	P46091	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	RGR	P47804	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	UCN	P55089	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	LIX1	Q8N485	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NXF1-205	ENST00000527497	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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