RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526630.2

GTF2H1-208, Transcript of general transcription factor IIH subunit 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GTF2H1, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF2H1-208	ENST00000526630	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KLC3	Q6P597	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PRR25	Q96S07	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MYNN	Q9NPC7	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SNX6	Q9UNH7	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630		A0A1W2PQD3	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630		B4DSR2	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630		B9A039	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	GPR171	O14626	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ABCD4	O14678	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	RIPK2	O43353	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	DNPH1	O43598	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	NDUFS7	O75251	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ADA	P00813	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ANPEP	P15144	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	COX5A	P20674	150 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	IVD	P26440	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	STX2	P32856	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SLC6A8	P48029	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PLTP	P55058	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PSG6	Q00889	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SLC22A25	Q6T423	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	BANP	Q8N9N5	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	RBBP8	Q99708	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GTF2H1-208	ENST00000526630	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms