RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 H3BQF6 201 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PCDH7O60245 1069 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZIC3O60481 467 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SMPD2O60906 423 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 REM1O75628 298 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TGM6O95932 706 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CGAP01215 116 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 IL1AP01583 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 IL3P08700 152 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FREM3P0C091 2139 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF17P17021 662 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 DPP4P27487 766 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CCKARP32238 428 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 EVI2BP34910 448 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MPIP34949 423 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 UGT2B10P36537 528 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PGM1P36871 562 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 B3GALT5-AS1P59052 145 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 LCP2Q13094 533 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 STARD4Q96DR4 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MTBPQ96DY7 904 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PAFAH2Q99487 392 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PIGQQ9BRB3 760 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MED18Q9BUE0 208 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FANCFQ9NPI8 374 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SENP1Q9P0U3 644 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF225Q9UK10 706 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 FBXL2Q9UKC9 423 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 GRID1Q9ULK0 1009 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 ARID1AO14497 2285 aa6.02□□□□□ -1.44
PDE4D-222ENST00000514552 MPDZO75970 2070 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 FAM157AC9JC47 383 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 C16orf97H3BN30 126 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 MANBAO00462 879 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 HSPB6O14558 160 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 FADS1O60427 444 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ADAP00813 363 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 NGFRP08138 427 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 POU2F1P14859 743 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 TAC1P20366 129 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 CASQ1P31415 396 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 HSD17B3P37058 310 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 GPR12P47775 334 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 NR1H2P55055 460 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 PKNOX1P55347 436 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 P2RX3P56373 397 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 SRYQ05066 204 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 TRADDQ15628 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 LTB4RQ15722 352 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ACKR1Q16570 336 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 DECR1Q16698 335 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 BEX5Q5H9J7 111 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 LGSNQ5TDP6 509 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 RAET1LQ5VY80 246 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 OR2L13Q8N349 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 OR2M3Q8NG83 312 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-222ENST00000514552 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms